MOL_LAB

⚛️ MOL_LAB – Moleküllabor (für Unterricht & Fortbildung)

Dieses Notebook zeigt, wie aus einer 2D-Struktur (SMILES) ein 3D-Molekül wird – inkl. Optimierung, Surface und Vergleich.

▶ Start (nur 1 Klick)

So funktioniert’s (für Schüler:innen)

1. Oben im Startbereich optional SMILES ändern (oder Standard lassen).
2. ▶ START MOL_LAB einmal ausführen (Run-Button der Zelle).
3. Im Tool:
   • 1 2D → zeigt die Strukturformel
   • 2 3D → erzeugt ein räumliches Modell
   • 3 MMFF/UFF → optimiert die Geometrie
   • 4 Surface → zeigt Ladungsverteilung (rot/blau)
   • Optional: Adv xTB, Vergleich, Torsionen, Achse/Zoom

Tipps

• SMILES bekommst du z.B. aus Ketcher/MolView oder aus PubChem.
• Wenn etwas nicht gleich läuft: Runtime → Restart runtime und nochmal START drücken.

Dateien im Repo

• MOL_LAB.ipynb – Start-Notebook (ein Klick)
• molekuellabor.py – die App (UI + Logik)
• README.md – diese Anleitung

Hinweis zu „Screenshots“

PNG-Screenshots aus WebGL können in Colab manchmal leer sein. → Nutze 3D-HTML Export, öffne die HTML lokal und mache dann einen Screenshot.